江西中医药大学马克思主义学院前身为马列主义教研室。1959年建校伊始设立，2002年3月更名为马克思主义理论和思想政治理论教学部（简称“两课”教学部）。2003年，“两课”教学部与经济与管理系合署办公；2007年，“两课”教学部更名为思想政治理论教学部（简称“思政部”）。2008年，思政部独立设置。2014年6月更名为马克思主义学院。
学院现有教职工57人。其中教授6人，博士10人、硕士生导师12人。有江西省高校思政课名师1人，江西省高校优秀思政课教师1人，校级“教学标兵”6名，校级“教学名师”1名。
学院2015年申报成功教育部医学人文素质教育基地。2017年获批中医文化学硕士点，2018开始招生。中医文化学硕士点主要包括中医药文化资源、中医生命伦理文化、中医药文化教育与传播三个研究方向。
中医药文化资源研究：凝炼中医药文化资源的内涵；挖掘和整理中医药文化资源；研究中医药文献、中医药文物的留存和保护状况；考察中医药非物质文化遗产的传承价值；探索中医药文化资源开发和利用的路径。
中医生命伦理文化研究：探究中医关于生命哲学的基本知识体系，生命的维系、生命的诊理、生命的养护等方面的价值追求；探讨中医伦理传统和道德精神、大医精诚之道；探析中医人（学生）立业、成人、处事之理。
中医文化教育与传播研究：中医文化发展史研究；中国共产党关于中医文化发展重要思想、重要论述研究；中医文化教育与传播的政策、制度、机制研究；中医文化对外传播的内容、方法、经验研究。
